«Молекулярные часы» для бактерий
Ученый из СевГУ совместно с коллегами из Германии и Франции разработал математическую модель, которая позволяет на основе анализа генома бактерий восстановить их эволюционную историю.
Бактерии не сохраняются в окаменелостях, поэтому хронологию и филогению их эволюции проследить трудно. Анализ бактериальных геномов также представляет собой сложную задачу из-за их пластичности, большого расхождения последовательностей и горизонтального переноса генов. Кроме того, разные гены бактерий мутируют с разной скоростью. В результате бактериальный геном превращается в сложную мозаику, фрагменты которой имеют разную эволюционную историю. Об этом сообщили в Телеграм-канале Минобрнауки России.
С помощью разработанного математического алгоритма ученые связали в одну модель эмпирические данные изучения бактерий с их эволюцией и смогли отделить сходства последовательностей, унаследованные от их общих предков, от сходств, полученных посредством горизонтального переноса генов. В результате стало возможным напрямую по геномам определить время расхождения бактериальных видов, решив таким образом давнюю проблему микробной геномики.
Комментарийлар